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主要解決的問題主要有兩個：一是異質(zhì)性（heterogeneity），比如a）鑒定某些因為含量（比例）較低而在常規(guī)RNA測序檢測時被“掩蓋”的細胞亞群；b) 檢測細胞群體中不同的個體細胞：比如

單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq)是在單個細胞水平對mRNA進行高通量測序的一項新技術(shù)，原理是將分離的單個細胞中微量的mRNA通過高效擴增后再進行高通量測序。

單細胞測序主要涉及單細胞基因組測序和轉(zhuǎn)錄組測序兩個方面，分別針對單細胞DNA及RNA進行序列分析和比較。單細胞測序一直是科學(xué)家關(guān)注的一個熱點。

流式細胞術(shù)作為一種可在單細胞水平上對大量細胞進行快速、準(zhǔn)確、多參數(shù)定量分析和分選的高技術(shù)；進行流式細胞術(shù)分析的前提是樣品為單細胞懸液，根據(jù)不同實體組織成分的特點可選擇不同的分散細胞的方法，以期達到單細胞產(chǎn)量高、細胞損傷小的目的。

實體組織 溫和組織處理器 的制備方法有那幾點 (1)機械法 1)用剪刀剪碎或者用鋒利的解剖刀剁碎組織; 2)將剪碎的組織加入勻漿器中勻漿; 3)用吸管或注射器抽吸細胞懸液，以分散細胞;

近期，Nature Methods發(fā)表了數(shù)篇關(guān)于大規(guī)模單細胞測序相關(guān)文章，包括文庫制備、測序方法、分析方法等，這里介紹其中的幾篇。

去年，Broad研究所的研究人員在《Science》上發(fā)表了一種稱為sNuc-Seq的單核RNA測序方法。

常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組分析方法通常需要103個細胞，所以無法揭示單個細胞之間基因表達的異質(zhì)性，也難以對諸如早期胚胎及異質(zhì)性的組織干細胞和腫瘤干細胞等少量細胞進行分析，而單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的出現(xiàn)為此提供了有效的研究工具。